Le MeSH (Medical Subject Headings) est le thésaurus de référence dans le domaine biomédical. La NLM (U.S. National Library of Medicine), qui l'a construit et le met à jour chaque année, l'utilise pour indexer et permettre d'interroger ses bases de données, notamment MEDLINE/PubMed. L'Inserm, qui est le partenaire français de la NLM depuis 1969, a traduit le MeSH en 1986, et met à jour la version française chaque année depuis lors. Dans le cadre d'un accord de coopération avec l'Inserm, l'Inist-CNRS (Institut de l'information scientifique et technique du CNRS) contribue à la mise à jour de la version française depuis 2004.
La version bilingue est souvent utilisée comme outil de traduction, ainsi que pour l'indexation et l'interrogation de bases de données en français.
more Permissions
L'Inserm met la version bilingue à la disposition de la communauté francophone, qui peut la consulter sur ce site ou l'obtenir sous la forme d'un fichier sous format XML sous réserve de signature d'une convention de concession de droit d'utilisation.
Natural Language
notes
Version RDF de la version francaise de la terminologie MeSH (MSHFRE); extraite avec l'outil UMLS2RDF tool développé par le NCBO et modifié par le projet SIFR (https://github.com/sifrproject/umls2rdf).
Copy the code below and paste it to your HTML page
Note:
If you would like to use Quick Jump across multiple ontologies:
You can enter a comma-separated list of ontology ids:
var BP_ontology_id = "NCIt,SNOMEDCT";
You can set the variable to 'all' to search all ontologies in SIFR BioPortal:
var BP_ontology_id = "all";
To include definitions in the Jump To drop-down, add the following variable in Javascript:
var BP_include_definitions = true;
In the code that you just pasted, make sure to change the path to the quick_jump.js file to point to the location where you put the file (relative to your HTML file)
For example, if you put the quick_jump.js file in the same directory as your HTML file, this is the code you would use:
In the header for the page where you want the form field, include the
form_complete.js
file.
On your form, for the fields where you want to use the class-selection widget, specify the field's class in the following format:
bp_form_complete-{ontology_id_list}-{value}
For example,
bp_form_complete-NCIT-uri
will use NCI Thesaurus (ontology id is NCIT) and will put the class URI in the field after the user selects the class from the pull-down list.
Note:
In addition to single ontology ids, you can use a list:
bp_form_complete-NCIT,NCBITAXON-uri
OR
use 'all' to search across all SIFR BioPortal ontologies:
bp_form_complete-all-uri
The autocomplete widget accesses ontology content from the latest version of the ontology.
You can use the following parameters to select which value will be placed into the user-visible input field:
shortid
put the short id of the class, as used in SIFR BioPortal (e.g., "Common_Neoplasm");
name
put the preferred name of the class (e.g., "Common Neoplasm");
In addition to the input element you defined, there are four hidden form elements that are created and then set when a user selects a class from the list. For example, if you create a field with this code: